Mendeley 对于想要基于云的参考文献管理和 Word 加载项的研究人员来说，是一个更简单、免费的起点；EndNote 更适合其机构、实验室或出版商工作流程已依赖于许可参考文献管理器的研究人员。两者都可以导入参考文献、组织 PDF 并在 Microsoft Word 中引用。决定因素取决于成本、协作限制、机构兼容性以及您对图书馆工作流程的控制程度。
本比较使用当前的官方文档。对于后面描述的证据工作流程，每个 Ponder 辅助的结论都可以追溯到原始 PDF 页面。Mendeley 和 EndNote 都不能仅仅通过格式化其引文就使未经证实的解释变得可信。
Mendeley 与 EndNote 概览
| 决策点 | Mendeley Reference Manager | EndNote 2025 |
|---|---|---|
| 入门价格 | 免费账户 | 275 美元一次性完整美国许可；150 美元学生；125 美元升级；30 天试用 |
| 免费存储 | 2 GB 个人存储空间，外加 100 MB 共享群组存储空间 | 许可产品附带云图书馆；机构条款可能有所不同 |
| 免费协作 | 创建最多 5 个私人群组，每个群组最多 25 名成员 | EndNote 生态系统内的图书馆共享和协作功能 |
| Word 工作流程 | Mendeley Cite 是一个独立的 Word 加载项，可与 Word Online 配合使用 | EndNote 2025 中的 Cite While You Write 以及 Word Online 支持 |
| Google Docs | 没有针对 Google Docs 的同等官方 Mendeley Cite 工作流程文档 | EndNote 2025 中增加了 Google Docs 支持 |
| 导入路径 | PDF 拖放、受监控文件夹、DOI 查找、BibTeX、RIS 和 EndNote XML | 导入过滤器、在线搜索、PDF 导入和当前的 EndNote 集成 |
| 典型适用对象 | 想要免费、以云为中心的个人和小型团体 | 有预算和既定惯例的机构或出版商相关团队 |
EndNote 的上述价格是一次性购买价格，而非年度学生费用。Mendeley 的免费群组和存储限制是当前支持值，而非无限协作承诺。
选择 Mendeley 以获得免费的云中心工作流程
免费的 Mendeley 帐户包含 2 GB 的个人存储空间。Elsevier 当前的支持文档还允许用户创建最多五个私人组，每个组最多 25 名成员，以及 100 MB 的共享组存储空间。这些限制足以满足小型阅读组或项目团队的需求，但在实验室提交大型共享 PDF 集合之前应检查这些限制。
Mendeley Reference Manager 是基于云的。可以通过将文件或文件夹拖到桌面应用程序中、导入 BibTeX、RIS 或 EndNote XML、使用受监控的文件夹或通过 DOI 查找记录来添加来源。网络导入器提供了另一种捕获路径。这些功能使研究人员能够轻松地将 PDF 文件夹转换为结构化库。
Mendeley Cite 是一个独立的 Microsoft Word 插件，可与 Word Online 配合使用。Elsevier 不再开发旧版 Mendeley Desktop 应用程序。版本 1.19.8 可能仍然可用，但该公司警告说，它将不会收到未来的更新，并且可能会因后续操作系统更改而停止工作。因此，新的设置应围绕 Reference Manager 和 Mendeley Cite 进行评估，而不是围绕旧的桌面教程进行评估。
选择 EndNote 以实现机构连续性
EndNote 2025 的前期成本更高：美国官方页面列出的完整许可证价格为 275 美元，学生价格为 150 美元，升级价格为 125 美元，所有这些都是一次性购买。提供 30 天试用版。根据 Clarivate 的条款，一个个人许可证可以安装在被许可人使用的最多三台计算机上。在付款之前，请检查您的大学是否通过站点许可证提供 EndNote。
当 EndNote 降低协调成本时，其价值最强。导师可能已经共享了一个 EndNote 库；一个部门可能正在教授它；或者出版商工作流程可能假定 EndNote 样式和 Cite While You Write。当前的 2025 版本支持 Word Online 和 Google Docs 以及传统的桌面 Word 工作流程，因此将其限制在桌面 Word 的比较已经过时。
Clarivate 还宣传了 6,000 多种输出样式，其实时样式查找器目前列出了 7,000 多个结果。这种广度对于专业期刊很有用。检查渲染的参考文献仍然至关重要，因为即使样式本身正确，导入的记录也可能具有错误的条目类型、缺失的页码范围或格式错误的作者姓名。
PDF、重复项和协作：测试您的真实语料库
这两种产品都可以组织 PDF 并识别潜在的重复项。公开的比较文章通常声称某个工具具有“更好的去重功能”，但这种说法在没有指定数据集和可重现测试的情况下是站不住脚的。重复行为取决于标题、DOI、作者字段和导入历史的质量。
使用您自己图书馆中最混乱的 100 条记录进行一个小测试。计算遗漏的重复项、误报以及合并后保留的元数据量。对于系统评价，请单独审计导入的记录数量、作为重复项删除的记录数量、筛选的记录数量和排除的记录数量。参考文献管理器可以辅助该过程，但它不能取代协议或筛选判断。
协作也意味着不仅仅是邀请他人。检查协作者是否可以访问附件，他们的存储配额是否受到影响，冲突如何解决，以及如果团队更换工具，最终的图书馆是否可以导出。Mendeley 的免费套餐公布了具体的群组限制。当机构已经管理访问和支持时，EndNote 可能更适合。
六步决策流程
- 检查机构默认设置。询问图书馆、实验室经理和主管他们的共享图书馆和模板使用哪个工具。
- 评估实际团队的成本。比较 Mendeley 公布的免费存储和群组限制与任何 EndNote 站点许可证或个人购买。
- 测试写作环境。Mendeley Cite 支持 Word 和 Word Online；EndNote 2025 支持 Word、Word Online 和 Google Docs。
- 导入相同的样本。使用 PDF、DOI 查找、RIS 以及您所在学科依赖的任何数据库导出。
- 审计重复项和元数据。记录错误，而不是依赖未经支持的通用排名。
- 在提交前导出。确认参考文献和附件可以转换为您的协作者可以重复使用的格式。
这两种工具都无法完成的工作
Mendeley 和 EndNote 管理引用层。文献综述还需要一个证据层：哪些论文使用可比较的方法，哪些发现相互冲突，哪些人群缺失，以及哪些限制在整个语料库中重复出现。一个图书馆可以组织得非常完善，但这种综合仍然没有写出来。
Ponder 是一个用于证据层的补充性人工智能研究工作区。它可以帮助可视化比较论文，并将结论与源页面联系起来。使用 Mendeley 或 EndNote 进行参考文献记录和最终引用格式化；当最困难的部分是解释这组论文的集体意义时，使用综合工作区。